1959年10月16日至31日在北一河召开了全国首届气功学术交流会议。这次会议是根据卫生部指示召开的。参加会议的有北京、上海、广东、福建、内蒙、黑龙江、湖南、湖北、浙江、山西、河北、河南、吉林、辽宁、山东、江苏、甘肃等共17个省、市、自治区61个单位84名代表参加了会议。会议报告和交流的64篇论文中，有治疗25种疾病的3063个病例（5例以下未予统计），其中胃、十二指肠溃疡2288例，神经衰弱191例，胃下垂159例，肺结核98例，慢性肝炎88例，慢性胃炎66例，矽肺病38例，风湿性心脏病26例，支气管哮喘22例，还有高血压、糖尿病、肾炎等，总有效率为89％。这是建国后首次气功学术会议，它标志着气功已进入临床实验阶段和基础理论研究阶段，也说明气功已作为医疗手段推广到全国、影响到世界，出现了建国后气功发展的第一个高潮。
　　1957年7月上海气功疗养所成立，由陈涛任所长。该所共设20个床位，工作人员30人，其中医务人员20人，以后又增设了武康路气功门诊，病床增加到80张。该所认真总结了蒋维乔先生在气功讲座中的经验教训。他们结合临床观察，发现练功者多有紧张现象，它既是病因，又是病果，既是影响练功效果的原因，又是练功方法（姿式、呼吸、心态）不当的结果，总之是练气功的关键问题。为了解除病员紧张情绪，练好气功，防止偏差，治疗疾病，各个环节上都应着眼“松”字；据此而整理出一套“放松功”，经推广应用，效果良好。后来放松功、内养功被人们誉称为“南北双壁”。
　　上海在运用现代科学方法对气功的原理方面，开始了呼吸、循环、神经等系统的实验研究；加强了临床和教学之间的协作，都取得了一些成果。在北京召开的全国卫生事业跃进交流大会上，气功疗法的贡献得到卫生部的表扬，上海气功疗养所被授予奖状。1960年中央卫生部委托上海气功疗养所举办了“全国气功师进修班”，为各省、市的医学院校、医疗单位培养了气功专业人才39人。还开办了上海市气功训练班，突击培训了一大批气功指导人员，为普及推广气功疗法创造了条件。该所编写的《气功疗法讲义》由上海科技卫生出版社出版，陈涛著《气功科学常识》也相继公开出版发行。
　　陈涛同志是上海医学气功的开拓者。陈涛同志生于1922年，家庭富有。抗日战争爆发后投入抗日救亡运动， 1940年参加中国共产党。曾为保管党中央秘密文件做出过贡献。1945年毕业于上海圣约翰大学文科，不久去解放区搞文化宣传工作。因用脑过度而神经衰弱，解放初因手枪走火右眼损伤被摘除，便长期休养，有时痴呆，记忆减退，话不成句，医生说恢复无望。1955年他开始学气功和太极拳，感觉良好，看到唐山气功疗养所刘贵珍气功治病的报道，对气功治病增强了信心。专心练功，一年多后病情明显好转，能阅读书报、思考问题了。为揭开气功之谜，决心献身于气功事业，提出申请，受到领导支持。1956年从市经委工业处调到市卫生局工作，负责筹办上海市气功研究机构，并兼任无锡太湖华东疗养院气功指导。他艰苦实干，专心调研、学习、大力举荐和任用有气功专长的人才。如著有《因是子静坐法》的蒋维乔老先生被聘为气功所顾问；原佛光疗养院院长陈乾明老中医被聘为气功所指导老师；对气功锻炼颇有成效的杨中一、耿午楼等，也被上海中医文献研究馆聘为兼职馆员。他们同气功所保持着经常联系和交流，并多次到唐山、北戴河参观学习。陈涛曾不辞劳苦地前往天台山，一天走数十里路，亲自拜访黄岩道士伍止渊，后经市卫生局同意，介绍病休干部七八人到天台山向伍止渊学气功半年左右，受益良多。1957年7月上海气功疗养所成立，陈涛任所长。他和大家总结经验，创编了“放松功”；提倡整体疗法，在积极练气功同时，要注意精神修养、规律生活和适应气候变化，在指导练功中强调：松静为主，动静结合，练养相兼，意气相随，要循序渐进，持之以恒。他主张用现代科学方法探讨气功机理， 1958年总结肯定了104例胃下垂和溃疡病的疗效。陈涛是上海市气功科研协作组的召集人，联系、推动着许多有科研实力的单位。这些单位以现代科学仪器测量练功时的经络情况；结合巴甫洛夫学说解释练功效果；采用脑电波、心电图、呼吸和血管容器描绘、爱克斯光透视等观察练功时的生理变化，进行分析。1958年曾获得卫生部的奖励。为推广普及气功疗法，举办了多次短期训练班，进行分析。1958年曾获得卫生部的奖励。为推广普及气功疗法，举办了多次短期训练班，组织编写了《气功疗法讲义》和《气功科学常识》，并先后撰写了一多篇论文在医药杂志上发表。上海气功研究所由此成为江南的一个气功先进单位。
　　第二阶段。“文化大革命”的十年是极“左”思潮泛滥的十年，对民族文化极尽摧残的十年。给中华民族的文化瑰宝一一气功和练气功的人扣上了“封建迷信”、“荒涎”、“荒唐”、“革命意志衰退”、“活命哲学”等等吓人的大帽子，甚至无限上纲上线，强加上“不革命”、“反革命”的罪名。在河北省会保定“文革”大批判中。因为涉及到“当权派”省长刘子厚和保定地委书记李悦农练气功的问题，所以批气功的声浪特别汹涌，并以此波及全省甚至全国。当时首当其冲的是五十年代气功的先进单位和先进人物。然而，从批判气功的时间上看，并不仅仅是起于于“文革”十年，实际上在“文革”之前，大批气功的“极左”之风就吹遍了气功领域；而气功界典型冤案的平反昭雪，则不少是在“文革”结束之后，由此可见，“左风”对气功界的压抑、破坏何其严重！
　　新中国气功事业的先驱者刘贵珍同志从1963年就挨整挨批了。挨整后被开除党籍降级撒职，到农场劳动改造。1980年才平反昭雪。刘贵珍1983年12月27日病故，享年仅63岁。
　　唐山气功疗养所的功绩被抹杀。搞气功成了搞封资修的罪行，气功疗养院的职工虽然也有“造反”两派，但都在1969年被清洁站接管，被派去扫大街掏厕所。气功疗养所的名义从此被撤销，疗养大楼调拔给其他单位占用，以后再也没有得到恢复。
　　北戴河气功疗养院的疗养业务停了好几年，气功活动停顿的时间更长。职工们没完没了地对气功进行批判。直到1978年党的三中全会以后才“苏醒”过来，逐渐恢复了气功活动。
　　上海气功疗养所也经受了同样的命运。在“左”倾思潮的冲击下，在“文革”前的1965年5月，上边“一声令下”，该所就被迫并入中医学院，实际上是被撤销了。
　　上海气功疗养所所长陈涛被迫离开了气功事业，调任龙华医院公费中医门诊部主任。在“文革”兴起后，对陈涛进行了残酷的批斗。 1968年3月27日被迫害致死，时年仅46岁；直到1978年12月才平反昭雪，死后十年才举行了追悼会。
　　此外，还有三位气功开拓者受到严重迫害